首先，我們要從基本概念上去區分它們。

       綠色農業是一種農業生產經營方式。加入WTO后，為了切實與世界農業的發展接軌，用符合經濟和環境發展的綠色農業提升中國農業的優勢，為此，立足我國國情，提出以生產并加工銷售綠色食品為軸心的農業生產經營方式，即綠色農業。（和中國特色社會主義一樣一樣的，由原國家農業部農墾司司長劉連馥先生提出）簡單說，綠色農業是政府推動按照綠色標準生產出來的農產品，就是為了達到比擬歐洲一般食品的安全標準。

       有機農業即遵照一定的有機農業生產標準，在生產中不采用基因工程獲得的生物及其產物，不使用化學合成的農藥、化肥、生長調節劑、飼料添加劑等物質，遵循自然規律和生態學原理，協調種植業和養殖業的平衡，采用一系列可持續發展的農業技術以維持持續穩定的農業生產體系的一種農業生產方式。

       另外，有機農業要求較高，不能使用農藥、化肥、生長促進劑等，禁止轉基因，土壤也不能有污染；綠色農業則沒有上述那么嚴格的要求，在生長過程中可以限時、限量、限品種使用安全性較高的化肥和農藥，也不排斥基因工程。